Los jugadores tienen la opción de controlar una de las cuatro Tortugas Ninja, cada una de ellas provistas de varios movimientos ofensivos y defensivos para el cuerpo a cuerpo y de su arma favorita. Así, se ofrece a los jugadores cuatro estilos de ataque muy diferentes según el Bo, los nunchakus, los cuchillos Sai o la katana entren en acción en las pantallas en 3D que pueden recorrerse con toda libertad. El juego, que refleja perfectamente la nueva serie de televisión, se centra en el combate mientras el Clan del Pie del malvado Shredder ataca por todos los lados.